Zur Kirchgemeinde Lipperswil-Wäldi gehören neben Lipperswil und Wäldi auch die Dörfer Engwilen, Gunterswilen, Hattenhausen, Hefenhausen und Sonterswil. Die Grenzen der Kirchgemeinde decken sich vollständig mit den Grenzen der Politischen Gemeinde Wäldi. Die Gottesdienste und das Gemeindeleben finden in den beiden Kirchen in Lipperswil und Wäldi statt. Die Kirchgemeinde Lipperswil-Wäldi besteht seit dem 1. Januar 2016 und zählt 449 Einwohnerinnen und Einwohner (2019).