Zur Kirchgemeinde Thunbachtal gehören neben Thundorf und Lustdorf auch die Dörfer Strohwilen, Wolfikon und Wetzikon. Die Kirchgemeinde umfasst die Politische Gemeinde Thundorf und Teile der Politischen Gemeinde Amlikon-Bissegg (Strohwilen und Wolfikon). Die Gottesdienste und das Gemeindeleben finden in den beiden Kirchen in Thundorf-Kirchberg und Lustdorf und im Kirchgemeindehaus in Thundorf statt. Die Kirchgemeinde Thunbachtal besteht seit dem 1. Januar 2016 und zählt 910 Einwohnerinnen und Einwohner (2019).